PRIMEX
From Biocourse
PRIMEX: rapid identification of oligonucleotide matches in whole genomes
- 주소: <html>http://bioinformatics.cribi.unipd.it/cgi-bin/primex_client.cgi</html>
- Web server/Application: Web server
- 국가명: 이탈리아
- 만든 곳: Laboratory of Functional Genomics and Proteomics, Masaryk University Brno
CRIBI Biotechnology Center, University of Padova - 사용자 환경:
- 버전: 1.1
- 입력형태:
- 출력형태:
- 내용: PRIMEX 는 잘못 짝지어진 것을 허락하고, 전체 유전체의 올리고 뉴클레오타이드 서열을 탐지할 수 있다. 워드 검사 테이블과 서버 기능을 사용하여, PRIMEX 는 클라이언트 소프트웨어로부터 의문점을 수용하며, 빠르게 매치시켜 회수한다. 우리는 이것을 현재 이용 가능한 도구보다 민감하고 빠르게 찾는다.
(PRIMEX (PRImer Match EXtractor) can detect oligonucleotide sequences in whole genomes, allowing for mismatches. Using a word lookup table and server functionality, PRIMEX accepts queries from client software and returns matches rapidly. We find it faster and more sensitive than currently available tools. )
