Nucleic acid structure

URL : http://ndbserver.rutgers.edu/

Motivation : 핵산에 관련된 정보의 수집과 배포

데이터 건수 : 2,840 Structures

국가 : 미국

기관 : The State University of New Jersey

다운로드 : http://ndbserver.rutgers.edu/download_data/index.html

내용 : NDB(Nucleic Acid Database)는 1992년 핵산 관련 정보의 수집과 배포를 목적으로 하는

NDB 프로젝트 팀에 의해 만들어졌다.

NDB는 핵산 3차 구조 관련 정보와 교육용 자료, 관련 tools를 제공한다.

URL : http://scor.lbl.gov

데이터 건수 : 579 PDB entries, 5350 internal loops, 2920 hairpin loops

국가 : 미국

기관 : 로렌스 버클리 국립 연구소

내용 : SCOR는 RNA 모티프 구조, 기능, tertiary interactions, 그리고 서로간의 상관관계에 관한

정보를 검색할 수 있는 데이터베이스이다.

SCOR는 PDB/NDB ID 또는 키워드, 서열정보 등을 이용한 검색이 가능하다.

URL : http://ntdb.chem.cuhk.edu.hk/

데이터 건수 : 5246건

국가 : 홍콩

기관 : 홍콩중문대학

내용 : Thermodynamic Database for Nucleic Acids(NTDB)는 핵산의 열역학적 특성, 구조,

그리고 실험적 방법에 관한 정보를 제공하는 데이터베이스이다. 핵 염기와 뉴클레오시드에

관한 정보도 얻을 수 있으며 핵산의 열역학적

특성을 직접 계산 할 수 있는 tool도 제공된다.

URL : http://www.sanger.ac.uk/Software/Rfam/

개발 프로그램 :

데이터 건수 : 503 families

국가 : 영국, 미국

기관 : 생거센터(The Sanger Institute), Washington University Department of Genetics

다운로드 : http://www.sanger.ac.uk/Software/Rfam/ftp.shtml

내용 : Rfam(RNA families database of alignments and CMs)은 영국의 생거센터와 미국 워싱턴

대학의 합작을 통해 만들어진 웹사이트로 단백질을 암호화하지 않는 일반적인 RNA의 다중

서열 정열과 공분산 모델에 관한 정보를 제공한다. RNA의 다중서열정열과 특정 RNA 집단에

관한 정보를 볼 수 있으며 플랫파일 형태로의 다운로드도 제공하고 있다.