Immunological databases
From Biocourse
IMGT
URL : http://imgt.cines.fr
Motivation :
개발 프로그램 :
데이터 건수 :
국가 : 프랑스
기관 : Université Montpellier II, CNRS
다운로드 :
관련이 있는 단백질에 관한 정보를 제공하는 데이터베이스이다. IMGT는 서열 데이터베이스,
유전체 데이터베이스, 구조 데이터베이스, 웹 리소스, 그리고 관련 툴로 구성된다.
IPD
Motivation : 면역 체계와 연관된 유전자 다형성에 관한 정보의 제공
개발 프로그램 :
데이터 건수 :
국가 : 영국
기관 : Anthony Nolan Research Institute
내용 : IPD(The Immuno Polymorphism Database)는 면역체계와 연관된 유전자의 다형성 연구에 관한
정보의 제공을 목적으로 만들어진 데이터베이스이다. IPD는 T‐cell에서 발현되는 수용체중 하나인
KIRs와 관련된 IPD‐KIR Sequence Database와 다형성과 연관되는 MHC의 서열관련 데이터베이스
(IPD‐MHC Sequence Database), 조직적합성 항원 서열관련 데이터베이스(IPD‐HPA Sequence Database),
그리고 암세포의 면역학적 특성에 관한 정보를 제공하는 데이터베이스(IPD‐ESTDAB)로 구성된다.
JenPep
Motivation :
개발 프로그램 :
데이터 건수 :
국가 : 영국
기관 : Edward Jenner Institute for Vaccine Research
다운로드 :
내용 : JenPep는 면역반응과 관련된 단백질과 펩티드간의 상호작용에 대한 수리적 정보를 제공하는
데이터베이스이다. JenPep는 간단한 인터페이스를 통해서 데이터의 빠른 검색을 도우며 JenPep에는
실험적 결과를 통해 확증된 정보만이 포함된다.
MHC‐Peptide Interaction Database
Motivation :
개발 프로그램 : MySQL
데이터 건수 :
국가 : 싱가포르
기관 : Bioinformatics Centre & Dept. of Biochemistry National University of Singapore
내용 : MHC‐Peptide Interaction Database(MPID)는 MHC와 펩티드의 상호작용에 관련된 서열, 구조
기능에 관련된 정보를 제공하는 데이터베이스이다. MPID에는 펩티드와 결합한 형태를 포함한 모든
MHC의 구조 정보가 포함되어 있으며 이들 복합체의 구조적인 특성이 강조되어 있다. MPID의
정보는 Protein Data Bank(PDB)의 데이터를 기반으로 한다.
