Gene expression data preprocessing
From Biocourse
Gene expression data preprocessing
- 주소: <html>http://bioinfo.cnio.es/cgi-bin/tools/dnarray/preprocess</html>
- Web server/Application: Web server
- 국가명: 스페인
- 만든 곳: Unidad de Bioinformática, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas (CNIO), Melchor Fernández Almagro
- 사용자 환경:
- 버전:
- 입력형태:
- 출력형태:
- 내용: 유전자 발현 데이터의 마이크로 어레이 예비 처리를 위한 웹 툴이다. 이것은 데이터를 분석하고, 가장 적당한 형질 전환을 제안하며, 사용자의 동의 이후에 계속한다. 규모 전환, 빠진 값의 관리, 복제 조절, 평면 패턴 여과와 패전 규격 통일을 포함하는 정상적 예비 처리 과정이 패턴 분석을 수행하기 전에 필요하다. 처리된 데이터 세트는 다른 패전 분석 도구로 보내질 수 있다.
(We present an interactive web tool for preprocessing microarray gene expression data. It analyses the data, suggests the most appropriate transformations and proceeds with them after user agreement. The normal preprocessing steps include scale transformations, management of missing values, replicate handling, flat pattern filtering and pattern standardization and they are required before performing any pattern analysis. The processed data set can be sent to other pattern analysis tools. )
