GandrKB

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GandrKB.jpg

GandrKB —ontological microarray annotation and visualization
주소 : http://www.bioinf.mdc-berlin.de/
Web tool/ application
 : application
국가명
 : 독일
만든곳 : Department for Bioinformatics, Max Delbrück Center for Molecular Medicine
Institute for Computer Science, Humboldt-Universität
Institute for Biomedical Engineering-Cell Biology, Universitätsklinikum
사용자 환경
 :
버전
:
입력 형태
 : 
출력 형태 : 
내용 : Gandr (gene annotation data representation) 지식 베이스(knowledge base)는 실험실 유전자 주석을 위한 온톨로지 틀이다. Gandr은 마이크로어레이 데이터와 주석을 시각화하고 편집, 쿼리하기위해 Protégé 2000을 사용한다. 유전자들은 새롭게 생성되거나 주입되고 제공된 온톨로지 개념은 주석으로 달아질 수 있다. 주석으로 달아진 유전자들은 지정된 개념 가능성들을 인계받을 수 있고 다른 것들과 연관될 수 있다. 지식 베이스의 결과는 유전자와 그것들의 기능적인 관계를 표현하는 노드(node)와 edge의 상호 작용적인 네트워크로 시각화할 수 있다. 이것은 인접하고 결합적인 성질을 가진 유전자 환경 탐구를 허용한다. 온톨로지 쿼리(query) 기술은 강력한 데이터 접근을 허용한다.
 

The Gandr (gene annotation data representation) knowledge base is an ontological framework for laboratory-specific gene annotation.Gandr uses Protégé 2000 for editing, queryingand visualizing microarray data and annotations. Genes can beannotated with provided, newly created or imported ontologicalconcepts. Annotated genes can inherit assigned concept propertiesand can be related to each other. The resulting knowledgebasecan be visualized as interactive network of nodes and edgesrepresenting genes and their functional relationships. Thisallows for immediate and associative gene context exploration.Ontological query techniques allow for powerful data access.

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