GEDI
From Biocourse
Gene Expression Dynamics Inspector (GEDI): for integrative analysis of expression profiles 
- 주소: <html>http://www.chip.org/~ge/gedihome.html</html>
- Web server/Application: Application
- 국가명: 미국
- 만든 곳: Vascular Biology Program, Departments of Pathology and Surgery, Children's Hospital/Harvard Medical School
- 사용자 환경;
- 버전: 2.1
- 입력형태:
- 출력형태: PDF, HTML
- 내용: GEDI는 활발하고 거친, 일치된 모자이크 이미지로 시료클래스나 시간 경로의 고차원적 발현 프로필을 번역하기 위한 자기 유기체화 지도를 사용하여 표현한다. GEDI는 흥미있는 유전자를 회수하기 위해 사용자에게 제출되며, 데이터의 어떤 구조의 중요한 가정이 없이 시료 공간과 시간, 유전자를 동시에 통과하는 분자 활성의 흥미있는 패턴의 식별을 조절한다. 유전체 규모의 활성의 중요한 변화는 Gestalt인식과 이것에 기초하여 빠르게 식별된다. GEDI는 의사와 같은 특별하지 않은 사용자에게 특히 유용하다.
(Genome-wide expression profiles contain global patterns that evade visual detection in current gene clustering analysis. Here, a Gene Expression Dynamics Inspector (GEDI) is described that uses self-organizing maps to translate high-dimensional expression profiles of time courses or sample classes into animated, coherent and robust mosaics images. GEDI facilitates identification of interesting patterns of molecular activity simultaneously across gene, time and sample space without prior assumption of any structure in the data, and then permits the user to retrieve genes of interest. Important changes in genome-wide activities may be quickly identified based on ‘Gestalt’ recognition and hence, GEDI may be especially useful for non-specialist end users, such as physicians.)
