ESTWeb

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ESTWeb: bioinformatics services for EST sequencing projects
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  • 주소: <html>http://bioinfo.iq.usp.br/estweb</html>
  • Web server/Application: Application
  • 국가명: 브라질
  • 만든 곳: Departamento de Bioquímica, Instituto de Química, Universidade de São Paulo
  • 사용자 환경:
  • 버전: 1.1
  • 입력형태:
  • 출력형태:
  • 내용: ESTWeb 은 큰 규모의 EST서열을 밝히는 프로젝트를 위해 데이터 처리와 저장을 형식을 갖추기 위해 계획된 인터넷에 기초한 소프트웨어 페키지이다. 이 패키지는 (a) 염기 서열을 밝히는 염색체 기록의 수령, (b) 염기 calling, 운반체 screening, 공용의 데이터베이스와의 비교, (c) 관계된 데이터의 분석과 데이터 저장, (d) 각 서열 질의 그래픽적 리포트의 일반화, (e) 생산력과 과잉의 통계적 리포트의 공포 등을 제공한다. 이 소프트웨어는 실제 시간 모니터링과 EST서열 프로젝트에 따라 EST서열 취득 증진의 수치화를 조절한다.
    (ESTWeb is an internet based software package designed for uniform data processing and storage for large-scale EST sequencing projects. The package provides for: (a) reception of sequencing chromatograms; (b) sequence processing such as base-calling, vector screening, comparison with public databases; (c) storage of data and analysis in a relational database, (d) generation of a graphical report of individual sequence quality; and (e) issuing of reports with statistics of productivity and redundancy. The software facilitates real-time monitoring and evaluation of EST sequence acquisition progress along an EST sequencing project. )