Database 관련 예제

From Biocourse

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letochiracvi

Name GO (Gene Ontology)
URL http://www.geneontology.org/
Motivation Computational Biology의 annotation시 사용하는 용어의 통일
개발 프로그램 Sourceforge CVS, MySQL, XML, DAG‐Edit, etc.
데이터 건수 2006년 6월 30일 - 19903 terms, 95.5% with definitions.
10728 biological_process
1743 cellular_component
7432 molecular_function
êµ­        가 다국적 연합
기        관 The Gene Ontology Consortium
다운   로드 http://www.geneontology.org/GO.downloads.shtml
내       용 GO는 생물학적 기능을 묘사하는데 사용될 수 있는 온톨로지(존재학) 를 만들기 위해서 대다수의 특이적인 유기체 데이터베이스들이 참여하여 만들어진 컨소시엄으로써 현재 컴퓨터 생물학에 있어서 용어의 통일이라는 중요한 역할을 수행하고 있다.
보충   설명 Go 구성은 구조적, 조절 어휘(용어), 정의를 DAG 폼으로 제작하였으며, ontology의 용어는 분자적인 기능, 생물적인 대사과정, 세포의 구성에 해당되는 유전자의 형태에 대해 유전자의 생성물 또는 유전자 대리자의 주석을 다는 것이다. 처음에는 파리, 효모, 그리고 쥐(mouse)의 모델 유기체의 이해를 돕기 위하여 개발되었으며, 최근 GO는 15개 이상의 모델 유기체 데이터베이스와 Swiss-Prot, InterPro 같은 종특이성이 없는 데이터베이스로 구성되어 있다.

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