CLENCH

From Biocourse

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Tool  이름
CLENCH
CLENCH 
주        소
Web tool/application
application
국        가
미국
기        관
펜실베니아 대학
사용자 환경  
버        전 2.0
입력   형태  
출력   형태  
내       용

microarray 자료의 분석은 수시로 생물학 해석을 위한 기능적인 종류로서 그때 마다 다시 나뉘는 유사한 표정 본을 가진 유전자로 다시 분할 된다.그런 기능적인 분류는 Gene Ontology (GO) 종류를 사용하여 일반적으로 이루어진다. 인간, 쥐 및 효모 유전자를 위한 기능적인 종류를 확인하고 분석하는 몇몇 프로그램이 있더라도, 그들의 아무도  Arabidopsis thaliana 자료를 못 받아 들인다. A.thaliana의 필요성을 다루기 위하여는, 우리는 A.thaliana 유전자에게 GO 주석을 검색하고 그 사용자에 의해 선택된 유전자의 리스트를 위한 기능적인 범주 분석을 수행하는 프로그램을 개발하게 되었습니다.


Analysis of microarray data most often produces lists of genes with similar expression patterns, which are then subdivided into functional categories for biological interpretation. Suchfunctional categorization is most commonly accomplished usingGene Ontology (GO) categories. Although there are several programsthat identify and analyze functional categories for human, mouseand yeast genes, none of them accept Arabidopsis thaliana data.In order to address this need for A.thaliana community, we havedeveloped a program that retrieves GO annotations for A.thalianagenes and performs functional category analysis for lists ofgenes selected by the user.
설치 및  사용방법