Biopython 프로그래밍 실습

From Biocourse

생물정보학 프로그래밍 특훈 

1일차 : 표준 입출력과 조건문 사용에 대한 프로그래밍 연습 I

2일차: 표준 입출력과 조건문 사용에 대한 프로그래밍 연습 II

3일차: 파일 핸들 및 Fasta 포멧 파일 파싱

4일차: GenBank 포멧 파일 파싱, 문자열 포멧팅, 서열 핸들(상보적서열, 역서열, 등 생성), 폴드 핸들

5일차: 6-frame translation,  sorting

6일차: 서열정열 메트릭스(BLOSUM, PAM) 파싱, 서열정열(global, local alignment,  Gotoh 알고리즘)으로 구현

프로그램을 작성하기전 다음과 같은 comment 를 프로그램 상단에 달아주시길 바랍니다.
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# Title     : make_superfam.py
# Usage     :  make_superfam.py [input file name]  [ouput file name]
# Function  :  make superfamily database
# Example   :
# Keywords  : superfamily, protein structure
# Options   :
# Author    : jong@biosophy.org
# Category  : proteomics
# Returns   :
# Version   : 20020211
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