Bio.SeqFeature.SeqFeature
From Biocourse
Bio.SeqFeature.SeqFeature1. 종류
- class
2. 설명
- Sequence 의 특정부분에 대한 정보를 저장할 수 있는 클래스 이다.
- 이 클래스는 인스턴스를 생성하여 사용하기 보다 parse() 메소드의 반환값이 되는 경우가 많다.
3. Initialize
- __init__(self, location=None, type='', location_operator='', strand=None, id="<unknown id>", qualifiers={}, sub_features=[], ref=None, ref_db=None)
: 이 클래스는 보통은 인스턴스를 생성하여 사용하지 않는다.
- location
: Sequence 의 그 특정부분의 위치 정보를 지정한다. 인수 타입은 Bio.SeqFeature 모듈 내의 위치정보를 지정하는 클래스 타입이다.
- type
: CDS 나 gene 같은 그 Sequence 내 특정부분의 의미(type)를 지정한다.
- strand
- id
- qualifiers
: Dictionary 타입이다. 특정부분의 부가적인 설명들이 Dictionary 형태로 지정한다.
- sub_features
- ref
- ref_db
4. Attribute
- location
: Sequence 의 그 특정부분의 위치 정보를 저장한다. 반환 타입은 Bio.SeqFeature 모듈 내의 위치정보를 지정하는 클래스 타입이지만 값은 string 으로 표현된다.
: 정보는 거의 저장되어 있다.
- type
: string 타입이다. CDS 나 gene 같은 그 Sequence 내 특정부분의 의미(type)를 저장한다.
: 정보는 거의 저장되어 있다.
- strand
: 정보는 거의 저장되어 있다.
- id
: 정보가 저장되어 있는 경우가 적다.
- qualifiers
: Dictionary 타입이다. 특정부분의 부가적인 설명들을 저장한다.
- sub_features
- ref
- ref_db
5. Method
