Bio.Fasta.Record
From Biocourse
Bio.Fasta.Record1. 종류
- class
2. 설명
- Fasta 형식의 자료를 저장하는데 사용한다.
- Bio.Fasta.RecordParser.parse() 나 Bio.Fasta.Iterator.next() 의 리턴값 형식으로 주로 사용된다.
- 이 클래스는 자료를 직접 입력하기 보다는 method 에 의한 결과로 저장된 자료를 읽어보는 데 주로 사용된다.
3. Initialize
- __init__(self, colwidth=60)
- colwidth
: 이 객체를 str(object)를 이용해서 출력할 때 sequence 부분을 몇개 단위로 잘라서 줄바꿈처리 할 것인가를 정한다.
: 객체를 선언하여 사용하는 경우는 별로 없어서 거의 지정하지 않는다.
4. Attribute
- title
: Fasta 포멧의 titile 부분을 저장한다. title 부분은 '>' 표시로 시작하는 줄 이다.
- sequence
: Fasta 포멧의 sequence 부분을 저장한다. sequence 부분은 '>' 표시 다음 줄부터 다음 '>' 표시가 있기 전 혹은 파일의 끝 까지 이다.
5. Method
