Bio.Blast.Record.HSP
From Biocourse
Bio.Blast.Record.HSP1. 종류
- class
2. 설명
- Blast search 의 결과를 담는 기능을 하는 클래스이다.
- 보통 Bio.Blast.Record.Alignment.hsps 속성을 통해 스크립트 코드 내에서 접근한다. 실제 직접 인스턴스를 생성하여 사용하지는 않는다.
3. Initialize
- __init__(self)
4. Attribute
- score
- bits
- expect
: float 타입이다. E value 값을 저장한다.
- query
: string 타입이다. Blast search 를 요청한 원본 sequence 이다.
- query_start
: integer 타입니다. 원본 sequence의 몇 번째부터 비교 했는지를 나타낸다.
- match
: string 타입이다. 원본과 검색결과의 sequence 가 서로 일치하는 부분들인지를 표시하는 값이다. 일치하면 '|' 로 표시된다. 일치하지 않으면 빈칸 이다.
- sbjct
: string 타입니다.
- sbjct_start
: integer 타입니다. 비교 한 부분이 검색된 sequence 의 원본에서 어디부터 인지 나타낸다.
5. Method
