Bio.Blast.Record.Alignment
From Biocourse
Bio.Blast.Record.Alignment1. 종류
- class
2. 설명
- Blast search 의 결과를 담는 기능을 하는 클래스이다.
- 보통 Bio.Blast.Record.Blast.alignments 속성을 통해 스크립트 코드 내에서 접근한다. 실제 직접 인스턴스를 생성하여 사용하지는 않는다.
3. Initialize
- __init__(self)
4. Attribute
- title
: string 타입니다. description 부분의 정보를 담는다. Fasta 형식이라면 '>' 으로 시작하는 라인이다.
- length
: integer 타입이다. Blast search 로 검색된 sequence 의 길이이다.
- hsps
: list 타입니다. Bio.Blast.Record.HSP의 list 이다. Bio.Blast.Record.HSP 가 실제적인 거의 모든 정보를 담고 있다.
5. Method
