Bio.Align.FormatConvert.FormatConverter
From Biocourse
Bio.Align.FormatConvert.FormatConverter1. 종류
- class
2. 설명
- FastaAlignment 나 ClustalAlignment 같은 Alignment 형식의 자료를 다른 Algnment 타입으로 변환해준다.
- 실제 적용할 수 있는 파일 형식은 Fasta 형식과 Aln 형식이다.
- 결국 Bio.Clustalw.ClustalAlignment 형식이나 Bio.Fasta.FastaAlign.FastaAlignment 형식의 자료를 취급할 수 있다.
3. Initialize
- __init__(self, to_convert)
- to_convert
: Bio.Align.Generic.Alignment 클래스를 상속받아 구현된 클래스들을 인수로 지정할 수 있다.
: Bio.Clustalw.ClustalAlignment 클래스나 Bio.Fasta.FastaAlign.FastaAlignment 클래스의 인스턴스를 지정할 수 있다.
4. Attribute
5. Method
- to_fasta(self)
: Initalize 시 변환하고자 입력했던 alignment 형식의 자료를 Bio.Fasta.FastaAlign.FastaAlignment 형식으로 변환한다.
- to_clustal(self)
: Initalize 시 변환하고자 입력했던 alignment 형식의 자료를 Bio.Clustalw.ClustalAlignment 형식으로 변환한다.
