Bio.Align.FormatConvert.FormatConverter

From Biocourse

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Bio.Align.FormatConvert.FormatConverter

1. 종류
    - class


2. 설명
    - FastaAlignment 나 ClustalAlignment 같은 Alignment 형식의 자료를 다른 Algnment 타입으로 변환해준다.
    - 실제 적용할 수 있는 파일 형식은 Fasta 형식과 Aln 형식이다.
    - 결국 Bio.Clustalw.ClustalAlignment 형식이나 Bio.Fasta.FastaAlign.FastaAlignment 형식의 자료를 취급할 수 있다.


3. Initialize

    - 
__init__(self, to_convert)

        - to_convert
            : Bio.Align.Generic.Alignment 클래스를 상속받아 구현된 클래스들을 인수로 지정할 수 있다.
            : Bio.Clustalw.ClustalAlignment 클래스나 Bio.Fasta.FastaAlign.FastaAlignment 클래스의 인스턴스를 지정할 수 있다.


4. Attribute



5. Method

    -
to_fasta(self)
        : Initalize 시 변환하고자 입력했던 alignment 형식의 자료를 Bio.Fasta.FastaAlign.FastaAlignment 형식으로 변환한다.


   - to_clustal(self)
        : Initalize 시 변환하고자 입력했던 alignment 형식의 자료를 Bio.Clustalw.ClustalAlignment 형식으로 변환한다.