ArrayXPath

From Biocourse

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Tool  이름
ArrayXPath

ArrayXPath
주        소
Web tool/application
Web server
국        가
대한민국
기        관
Seoul National University Biomedical Informatics (SNUBI)
사용자 환경  
버        전  
입력   형태 tab-delimited text file
출력   형태 경로 도표(pathway diagram)를 포함한다.
내       용

ArrayXPath는 Scalable Vector Graphics(SVG)를 사용하여 통합된 생물학적 경로 공급원(pathway resources)에 대해 microarray 유전자 발현 데이터를 지도화 하고 시각화하기 위한 웹 기반 서비스이다.
중요한 생물 데이타베이스를 통합하고 경로 공급원(pathway resources)을 탐색함에 따라, ArrayXPath는 자동으로 microarray 프로브들과 경로 요소들(pathway elements)로부터 식별자들(identifiers)의 다른 종류들을 지도화 시켜준다.
유전자 발현 클러스터(cluster)들을 입력했을 때, ArrayXPathsms 각 클러스터들에 대해서 가장 잘 맞는 경로들 (pathways)의 목록을 만들어 준다.. 


ArrayXPath is a web-based service for mapping and visualizing microarray gene-expression data for
integrated biological pathway resources using Scalable Vector Graphics(SVG).
By integrating major bio-databases and searching pathway resources, ArrayXPath automatically maps different types of identifiers from microarray probes and pathway elements.
When one inputs gene-expression clusters, ArrayXPath produces a list of the best matching pathways for each cluster.
설치 및  사용방법 　
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