ABNER
From Biocourse
ABNER : an open source tool for automatically tagging genes, proteins and other entity names in text
- 주소 : <html>http://www.cs.wisc.edu/~bsettles/abner/</html>
- Web tool/ application : application
- 국가명 : 미국
- 만든곳 : Department of Computer Sciences and Department of Biostatistics and Medical Informatics, University of Wisconsin-Madison
- 사용자 환경 : Linux, Windows XP, Solaris, and Mac OSX
- 버전: 1.5
- 입력 형태 :
- 출력 형태 :
- 내용 : ABNER (A Biomedical Named Entity Recognizer)는 분자 생물학 텍스트를 마이닝(mining)하기 위한 오픈 소스 소프트웨어 툴이다. 이 툴의 핵심은 철자가 바른 문맥상의 특징의 다양성으로 조건부의 변칙적인 영역을 사용한 기계 학습 시스템(machine learning system)이다. 1.5가 가장 최근 버전이고, 이 버전은 감각적이고 직접적으로 사물을 판단하는 그래픽 인터페이스를 가지며 표준 전자 코퍼스에서 훈련된 tagging entities(예를들면, 단백질과 세포계(cell line))의 두 모듈을 포함한다. 이 버전은 사용자가 ABNER를 그들 고유의 시스템이나 새로운 전자 코퍼스의 트레인 모듈과 통합시키는 것을 허용하는 Java application 프로그래밍 인터페이스도 포함한다.
ABNER (A Biomedical Named Entity Recognizer) is an open source software tool for molecular biology text mining. At its core is a machine learning system using conditional random fields with a variety of orthographic and contextual features. The latest version is 1.5, which has an intuitive graphical interface and includes two modules for tagging entities (e.g. protein and cell line) trained on standard corpora, for which performance is roughly state of the art. It also includes a Java application programming interface allowing users to incorporate ABNER into their own systems and train models on new corpora.
